一、警令部
負責市局文秘工作、公文管理、政務信息、政府信息公開工作，負責市局對外聯絡、重要會議活動組織協(xié)調；負責市局檔案管理和史志編纂工作；起草、審核重要公文，指導全市公安機關理論調研，負責重慶警察協(xié)會工作；承擔市局信訪工作領導小組日常辦事機構職責；受理公民或社會組織的信訪事項，承辦上級機關交辦、領導同志批示的重要信訪案件；指導全市公安機關信訪工作，協(xié)調跨地區(qū)、跨部門信訪案件的查處工作；組織指導全市公安機關績效考評工作，負責公安統(tǒng)計工作，對上級機關重要決策部署及上級領導批示指示的重要工作進行督辦；上級交辦的其他工作。
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二、政治部
負責指導全市公安隊伍建設，按權限進行干部管理；負責全局機構編制、人事調配、工資福利、優(yōu)待撫恤、警銜管理、教育培訓、表彰獎勵等工作；組織、指導全市公安宣傳、公安文化建設；負責離退休人員、警務輔助人員日常管理工作。
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三、警務保障部
負責公安經費資產管理、裝備管理、機關事務管理、基本建設和應急保障等警務保障工作。
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四、警務督察總隊
負責對重慶市公安局所屬單位和下級公安機關及其人民警察依法履行職責、行使職權和遵守紀律的情況進行監(jiān)督；統(tǒng)籌協(xié)調、督促指導全市公安機關維護民警執(zhí)法權威工作。
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五、審計處
依照審計有關法律法規(guī)和內部審計規(guī)章制度，組織開展對全市公安機關貫徹落實重大經濟政策措施、財政財務收支、領導干部經濟責任、投資項目、執(zhí)法活動財物、內部控制及風險管理等經濟活動的審計工作，依法依規(guī)實施獨立、客觀的審計監(jiān)督、評價和建議，促進公安機關完善治理、實現目標。同時，對全市公安機關內部審計工作進行業(yè)務指導和監(jiān)督。
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六、科技信息化總隊
牽頭擬定科技強警工作規(guī)劃；組織研究、開發(fā)公安專用裝備，制定全局公安科技信息化建設標準、制度；承擔公安科技立項、科研開發(fā)、成果管理和技術推廣等工作；完成上級交辦的其他事項。
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七、經濟犯罪偵查總隊
負責打擊《刑法》規(guī)定的77種經濟犯罪案件，主要包括妨害對公司、企業(yè)的管理秩序罪，破壞金融管理秩序罪，金融詐騙罪，危害稅收征管罪，擾亂市場秩序罪等；負責對全市經偵工作的組織、指揮、指導和協(xié)調；負責辦理上級交辦以及其他情節(jié)嚴重的重大、復雜經濟案件；負責經偵隊伍業(yè)務培訓。
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八、治安管理總隊
貫徹實施治安管理法律法規(guī)和政策規(guī)定，組織指導全市公安機關開展治安管理工作。依法組織指導社會治安防控體系建設和社會面治安巡邏防控；依法指導協(xié)調處置重大群體性事件和影響社會穩(wěn)定的突出問題；依法組織指導監(jiān)督查處治安案件和由治安部門負責辦理的刑事案件，整治突出治安問題；依法組織指導監(jiān)管槍支及危爆物品、娛樂服務場所、特種行業(yè)、保安服務業(yè)；依法指導管理集會、游行、示威和組織監(jiān)督實施大型群眾性活動、公共場所人員聚集活動治安保衛(wèi)；依法組織指導監(jiān)督開展國家機關、社會團體、企事業(yè)單位、重要基礎設施、重點建設工程的內部安全保衛(wèi)和客運汽車、出租車治安管理；依法組織指導開展公安派出所規(guī)范化建設、社區(qū)警務工作、群防群治隊伍建設和監(jiān)督管理戶籍、流動人口；依法管理制發(fā)居民身份證、港澳臺居民居住證；完成上級交辦的其他事項。
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九、刑事偵查局
掌握全市刑事犯罪動態(tài)，收集、通報、交流刑事犯罪信息，擬訂預防、打擊對策；組織、指導全市公安機關刑事偵查部門開展《公安部關于刑事案件管轄分工規(guī)定》所涉及刑事案件的偵查工作，直接辦理省級事權和中央、市委、市政府及市局交辦的重特大案件的偵查工作；規(guī)劃刑事技術工作的發(fā)展，組織刑事技術的推廣應用，對全市公安機關重大、疑難刑事案件提供技術支援和服務；為全市公安機關開展刑事偵查工作提供業(yè)務培訓。
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十、出入境管理局
承擔境內持普通護照外國人居停留、簽證管理工作，負責各類因私出入境證件的受理、審批和簽發(fā)；承擔國籍、外國人永久居留、口岸簽證管理事務；負責移民事務服務相關工作；負責港澳臺人員來內地居停留、相關證件簽發(fā)管理工作；負責查處出入境違法犯罪活動，執(zhí)行境外人員遣送出境任務；組織、指導、監(jiān)督全市公安機關出入境管理機構開展出入境管理工作。
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十一、網絡安全保衛(wèi)總隊
組織、指導全市網安部門開展監(jiān)督管理公共信息網絡的安全保護和監(jiān)察工作。組織開展全市計算機信息系統(tǒng)等級保護工作；承擔網絡與信息安全信息通報中心工作；偵辦涉網違法犯罪案件；防范和查處其他危害公共信息、網絡安全的違法犯罪行為等。
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十二、監(jiān)所管理總隊
負責全市看守所、拘留所、強制隔離戒毒所等公安監(jiān)所業(yè)務指導工作；制定全市公安監(jiān)管工作制度、規(guī)范并負責監(jiān)督檢查；指導全市公安監(jiān)所管理教育工作，依法保障被監(jiān)管人員合法權益；指導全市公安監(jiān)所安全防范工作，查處安全事故；規(guī)劃和指導全市公安監(jiān)所設施裝備建設和信息化建設、應用工作；管理市局直屬公安監(jiān)所；完成上級交辦的其他事項。
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十三、交通管理局
負責起草道路交通安全管理方面的地方性法規(guī)草案、政府規(guī)章草案和規(guī)范性文件；指導、檢查、監(jiān)督全市公安交管部門履行管理交通職能；監(jiān)督指導全市公安交管部門依法查處道路交通安全違法行為，預防和處理交通事故，維護道路交通秩序；組織實施和指導開展重要交通警保衛(wèi)工作；組織指導全市交通安全宣傳教育工作，交通科技信息化和道路交通設施管理工作；負責全市機動車和駕駛人管理及全市高速公路、城市快速道路交通安全管理等工作。
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十四、法制總隊
牽頭市局執(zhí)法規(guī)范化建設、法治政府建設等公安法制工作，具體承擔地方公安立法、法律政策研究、內部執(zhí)法監(jiān)督、執(zhí)法質量考評、刑事賠償復議、案件指導協(xié)調、執(zhí)法信息化建設等職責。
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十五、禁毒總隊
承擔市禁毒委員會辦公室日常工作；掌握全市毒情動態(tài),收集分析全市禁毒工作情況；牽頭負責全市涉毒案件偵辦、禁吸戒毒、禁種鏟毒、禁毒宣傳、易制毒化學品管理、毒品突出問題和突出地區(qū)整治；牽頭負責地方性禁毒法制建設和制定全市公安機關禁毒執(zhí)法工作的規(guī)范性文件；負責毒品檢驗鑒定工作。
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十六、特警總隊
參與處置暴力恐怖犯罪事件；參與處置嚴重暴力性犯罪事件；參與處置暴亂騷亂事件；參與處置大規(guī)模聚眾滋事等重大治安事件；參與重大活動的安全保衛(wèi)任務；擔負特定的巡邏執(zhí)勤任務；參與重大自然災害的搶險救援；組織、指導全市特警訓練、演練；承擔上級交辦的其他任務。
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十七、打擊假冒偽劣犯罪商品偵查總隊
負責收集、分析全市食品、藥品、知識產權等領域違法犯罪動態(tài)，擬定預防打擊對策；組織、指導全市各級公安機關打擊假冒偽劣商品犯罪偵查部門開展偵查工作，以及打假領域專項行動；偵辦重（特）大危害食品藥品安全犯罪案件和侵犯知識產權犯罪案件；會同市場監(jiān)管、農業(yè)、煙草、文旅等市級相關部門做好假冒偽劣商品聯動執(zhí)法工作；協(xié)調協(xié)查跨省、市以及涉外假冒偽劣商品犯罪案件。
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十八、環(huán)境安全保衛(wèi)總隊
研究擬定全市公安機關環(huán)境安全保衛(wèi)工作規(guī)范并負責監(jiān)督檢查；負責與相關行政執(zhí)法部門建立銜接聯動機制，參與專項整治工作；組織、指導、協(xié)調全市公安機關（含專業(yè)公安機關）偵辦刑法所規(guī)定的破壞環(huán)境資源保護犯罪的刑事案件；偵辦市委、市政府和公安部交辦的影響環(huán)境安全的重大案（事）件；承擔市公安局交辦的其他工作。
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十九、森林警察總隊
負責公安機關森林和草原防滅火日常工作，協(xié)同林業(yè)、應急等部門開展森林防滅火相關工作；負責查處森林和草原領域或其他違法犯罪行為；承擔市局交辦的其他工作。
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二十、水上分局
負責主城區(qū)長江、嘉陵江水域公安管理工作；宣傳貫徹有關公安管理的法律、法規(guī)、規(guī)章；指導、協(xié)調公民、法人和其他組織開展水域治安防范；檢查水域治安情況；對船舶、水域相關場所及其從業(yè)人員進行治安管理；負責管轄案件查處偵辦，處置水域治安突發(fā)事件；負責轄區(qū)重大活動安全保衛(wèi)、重要警衛(wèi)工作；負責轄區(qū)道路交通安全管理；參與防汛、搶險、救援工作；依法履行其他職責；掌握全市水域治安管理動態(tài)，研究預防、打擊、應對工作措施；指導區(qū)縣公安機關依法開展水域公安管理工作。
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二十一、軌道交通分局
維護全市已投入運營的軌道交通區(qū)域（含附屬設施）的公共安全；預防、制止、偵查全市已投入運營的軌道交通區(qū)域內（含附屬設施）的刑事案件、治安案件；維護全市軌道交通區(qū)域（含附屬設施）治安秩序，參與軌道交通系統(tǒng)社會治安綜合治理；處置全市軌道交通區(qū)域（含附屬設施）重特大治安災害事故和突發(fā)性事件；對軌道交通安全監(jiān)督管理和消防安全實施監(jiān)督檢查。
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二十二、機場分局
負責偵辦轄區(qū)政治安全案件，堅持總體國家安全觀，堅決維護國家政治安全；負責貫徹執(zhí)行國家和重慶市有關空防安全工作的法律、法規(guī)和方針、政策，負責維護機場區(qū)域正常運輸、生產、經營秩序的工作；負責依法做好機場轄區(qū)反恐應對處置工作，指導、監(jiān)督轄區(qū)重點部位單位反恐防范工作；負責維護機場轄區(qū)安全穩(wěn)定工作，協(xié)助屬地公安機關開展相關工作；負責預防及偵破轄區(qū)危害民用航空安全犯罪及其它刑事犯罪案件；負責對飛行機組、安檢部門及其他有關部門移交的非法干擾事件或事項進行查處；負責機場突發(fā)事件中現場封控、案（事）件處置調查、交通管制等應急救援工作；負責安檢現場巡防工作，維護安檢現場治安秩序；負責機場轄區(qū)內治安管理和道路交通管理工作（不含飛行區(qū)道路交通管理）；負責航空安全保衛(wèi)信息的收集、統(tǒng)計和上報工作；負責對全市區(qū)域內其他民用機場公安機關進行空防、治安業(yè)務指導；完成上級交辦的其它工作任務。
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二十三、重慶警察學院
主要負責大專、本科學歷教育，相關科學研究、專業(yè)培訓、學術交流。
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